医疗净化工程在初步建设完毕之后接下来的步骤是进行装修设计，手术室净化对于室内装饰有着非常严格的要求，使其在功能要求的前提下，减少因材料和构造而产生或积聚的尘菌，这对预污染、降低术后感染率是非常重要的。

层流手术室净化地面装修

由于地面的污染度比墙要高得多，大量尘粒由于医护人员在地板上的走动和设备的移动而产生，故地面装修应引起设计人员的重视。地面装修应做到平整、光滑、耐侵蚀(酸、碱、药)、易清洁。常采用现浇水磨石，取其光滑、不起尘、静电之长，但不宜采用过氧乙酸稀释液洗消，否则会与碱性的水泥起反应导致麻面。

地面装修可选用橡胶、聚胺脂涂料、树脂类板材等，如在欧美、日本的许多医疗手术环境中，都采用了弹性塑胶卷材作地面材料。它显著的优点，是少接缝(通常采用热熔焊接进行卷材间的连接，焊条由与卷材相同的塑胶材料制成)，可避免污物及的堆积，另外，它还具有耐污易洁、脚感舒适、花纹款式多样、安装及换简便等水磨石无法与之相比较的优点。

在垂直手术室净化，如采用地面或地沟回风，回风部位面板应选用块状活动隔栅地板。地面不宜设地漏，否则应设高水封地漏，以透气污染洁净室内空气。

层流手术室净化门窗装修

在无窗的手术室净化工程中，医护人员及病患者因与外界隔，都容易产生抑郁、“被监禁”等不良感觉，不利于手术顺利进行(尤其是时间较长的大型手术)。因而笔者认为，洁净手术室可根据实际情况，适当设置窗户，手术室内的环境气氛，同时利于室外医护人员及时了解手术情况，不入内即可与室内人员进行沟通。

层流手术室净化门位设置与气流流向和手术床有很大关系，在水平层流手术室，门位设在下风向，在其他手术室，门设在病人脚的方向，可以止进出人流对病人的影响。