以下是需要在五莲花火烧板深层清洗的过程中注意的问题：
1.要先进行试验。五莲花火烧板的“病症”是千差万别的,例如水斑的形成可以由多种易潮解盐类所造成。因此,在不了解污迹具体成因的情况下我们建议先作小试验。
2.要仔细对清洗剂进行选择。一些劣质的清洗剂相当于一些强酸,使用后很可能导致五莲花火烧板发生更严重的病变,如表面水斑和盐碱斑、失光和粉化、疏松溶蚀和泛黄等等。因此建议使用者选择的产品应该是好的厂家的高质产品，其次，应该在清洗处理前对不准备清洗的部分进行保护,在清洗处理完毕后清除残留的化学品。另外,应请有关专家对石质文物的清洗论证。
一般来说五莲花火烧板深层清洗应包括至少以下三个步骤：
1.清洗剂经过渗透过程进入五莲花火烧板的毛细孔;
2.在五莲花火烧板毛细孔中的清洗剂与污垢分子发生物理的或化学的作用;
3.通过吸出或稀释等步骤将作用后的残留物进行清除。
完成深层清洗的基本操作是这里的开始和结束这两步是需要的,而中间的一步能与污垢分子发生作用的清洗剂，需要根据五莲花火烧板的材质、污垢的性质以及处理过程的方便来选择，这就需要精心的设计和实验，因此化学方法在这里有着别样的效果。

目前我们可以对盐斑与白华、清洗锈黄斑、有机色斑、部分水迹和水斑等病变使用不同种类的清洗剂进行清除,并且新的清洗剂也在继续改进和开发中。我们除了常见的化学清洗法以外也在对一些的更加安全的物理清洗方法进行试验,例如采用超声波、激光、电化学或粒子流等清洗方法。